使用矽晶圓或納米碳管(CNT)制作成針尖小于100nm(納米)的納米，當納米由“金屬固體”表面掃過時，接觸“金屬”表面會導電，眼科手術顯微鏡利用導電的大小來控隨物體表面高低起伏而上下移動，可以量測“金屬固體”(良導體)表面。
將上下移動情形記錄下來，并且利用電腦模擬物體表面三維高低起伏而繪出相對應的三維圖形。
眼科手術顯微鏡的解析度與納米的尺寸有關，可以用來觀察大約1nm(納米)的結構，因此可以看到由電腦模擬的原子影像。
眼科手術顯微鏡的調整
1.每次在使用顯微鏡檢查樣品前須先調整顯微鏡，以得到均勻亮度的視野，使其具有相位差之效果。
2.在鏡檢前，先以HSE/NPL檢查玻片，測試顯微鏡之偵測極限
(1)取出HSE/NPL檢查玻片，將玻片中心置于接物鏡下，以放大率400倍觀察，此倍率偵測直徑大于0.25μm之纖維。
(2)在顯微鏡得計數區域內，將溝紋線對準焦點。該玻片包含有七組溝紋，每一組有20條細紋，可見度隨著1至7組而趨不明顯。
眼科手術顯微鏡具有太高或太低放大倍數之顯微鏡均不適合纖維計數的需求，
因此在觀察玻片時，只需看到1至5組即可（4及5組必須部份可見，但是不同顯微鏡之間所見的清晰度會有所不同）
(3)如果影像的品質降低時，可把顯微鏡的鏡片擦拭清潔，若是依然無法解決，則應進行顯微鏡維修與保養。
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